我國工廠養(yǎng)殖目前受水處理成本的壓力，仍主要以流水養(yǎng)殖、半封閉循環(huán)水養(yǎng)殖為主，真正意義上的全封閉循環(huán)水養(yǎng)殖企業(yè)較少。流水養(yǎng)殖和半封閉養(yǎng)殖方式產(chǎn)量低（單位水體產(chǎn)量10—15千克/米2·年）、耗能大、效率低，與先進國家技術密集型的循環(huán)水養(yǎng)殖系統(tǒng)相比，在系統(tǒng)的循環(huán)水率、系統(tǒng)輔助水體的比率等關鍵性能方面基本接近國際水平，在設備、工藝、產(chǎn)量（先進技術的產(chǎn)量達100千克/米2·年以上）和效益等方面，以及生物凈化系統(tǒng)的構建、凈化效率和穩(wěn)定性、系統(tǒng)集成度、系統(tǒng)穩(wěn)定性等方面仍存在著一定的差距。
項目投產(chǎn)前，首先需要決定養(yǎng)殖品種：因為底息類的魚池設計有區(qū)別，同時還需要對生物習性了解清楚：喜歡靜水，還是喜歡頂水；適宜水溫等等條件，不一而足。再了解了生物習性后，工廠化循環(huán)水養(yǎng)魚成功與否取決于以下幾個主要條件：溶氧量、水質、水溫，如果是海魚的話還有鹽度。副條件還有：ph、硬度、鹽度(淡水魚)、光照等。買魚苗后先進行觀察篩選（15天以上），把那些狀態(tài)不好的，比如明顯有寄生蟲、殘疾等不適合的剔除了，省的以后麻煩。在觀察期間還會死魚，除了體質問題外，還有一個因素是水體各元素含量不同導致的。
眾所周知水產(chǎn)養(yǎng)殖*重要的是養(yǎng)殖水的質量，著水產(chǎn)養(yǎng)殖水平的提高，大量餌料、肥料、漁藥等物質投入，帶來大量有機廢物沉積或溶解于養(yǎng)殖水體中，導致有毒有害物質增加和溶解氧供求矛盾激化，造成養(yǎng)殖水質量不斷惡化，這種現(xiàn)象我們稱之為“死水”。很多外塘養(yǎng)殖都會出現(xiàn)這樣的情況，導致水產(chǎn)品的養(yǎng)殖密度低下，達不到社會需要的價值較高的安全水產(chǎn)品。