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        1. 歡迎來到淘金地

          《PNAS》解讀:分子互作機制

          來源: 發(fā)布時間:2024-10-21

          第一步,確定與下游蛋白分子的互作關(guān)系 

          進行內(nèi)源Co-IP實驗和GST pulldown實驗,發(fā)現(xiàn)USP8與GPX4互作(圖1a-c)。 


           第二步,USP8與GPX4蛋白結(jié)合的具**置 

          為了探索USP8與GPX4蛋白結(jié)合的位置,針對USP8構(gòu)建不同的突變體分別進行Co-IP實驗,發(fā)現(xiàn)USP8通過 aa1-313、aa715-1118區(qū)域與GPX4結(jié)合(圖1d-e)。 


           第三步,USP8如何影響GPX4蛋白的穩(wěn)定性 

          USP8是一個去泛素化酶。Co-IP分析發(fā)現(xiàn),USP8能降低GPX4的泛素化水平,而酶非活性突變體USP8-c786a則不能去除GPX4的泛素鏈,表明USP8通過其去泛素化酶活性去除GPX4的泛素化(圖1f)。 

           圖1 USP8通過其去泛素化酶活性去除GPX4的泛素化(Ref. Fig 4/S4)


           第四步,確定USP8去除GPX4的Ub K48鏈泛素化 

          泛素分子可以通過其七個賴氨酸(K)殘基中的一個(K6、K11、K27、K29、K33、K48和K63)連接形成不同的泛素鏈?;诖?,Co-IP分析發(fā)現(xiàn)GPX4被K27和K48連接的泛素化修飾(圖2a)。另外,Co-IP分析顯示USP8過表達降低GPX4上K48連接的泛素化,而不影響K27連接的泛素化(圖2b),表明USP8主要去除GPX4上K48連接的泛素化。 體外去泛素化試驗表明(注:Ub(K48O)(只有完整的Lys48殘基的Ub)),USP8過表達以去泛素酶活性依賴性方式去除GPX4上K48連接的泛素化(圖2c)。 


           第五步,確定USP8去除GPX4蛋白泛素化位點 

          之前的研究已報道K48、K125、K127、K135和K151是GPX4的潛在泛素化位點。構(gòu)建不同的泛素化位點突變體進行Co-IP分析,發(fā)現(xiàn)GPX4 K48R、K125R、K127R和K151R突變體K48連接的泛素化減少(圖2d)。另外,USP8過表達降低GPX4 WT、K125R、K127R和K151R突變體的泛素化,但未能消除GPX4 K48R突變體的泛素化(圖2e)。表明USP8主要去除GPX4上K48殘基的泛素化。 表明USP8作為穩(wěn)定GPX4的關(guān)鍵上游調(diào)節(jié)因子,主要通過去除GPX4上K48連接的泛素化來防止其蛋白酶體介導(dǎo)的降解。 

           圖2 USP8去除GPX4上K48殘基的K48鏈泛素化(Ref. Fig4/S4)


          全文分享可查閱:【《PNAS》解讀:去泛素化修飾-順序漸進-刨根問底。去泛素化酶USP8靶向鐵死亡提高腫LIU免疫治L的機制】。  


          如有泛素相關(guān)機制研究,歡迎留言探討。

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